Τα όρη και οι οροσειρές του νομού Ρεθύμνης διασχίζονται από εξαιρετικής ομορφιάς φαράγγια. Το Κουρταλιώτικο φαράγγι που έχει μήκος 3 χιλιόμετρα και καταλήγει στη φημισμένη λίμνη του Πρέβελη, το φαράγγι του Κοτσιφού που ξεκινά από το χωριό Κάννεβος και καταλήγει στο χωριό Σέλλια, το φαράγγι της Πατσού στο Αμάρι, των Πρασσών που καταλήγει στον Πλατανιά στη βόρεια παραλία ανατολικά της πόλης του Ρεθύμνου, το Αρκαδιώτικο, των Βεδέρων, των Μύλων και άλλα μικρότερα.

Κουρταλιώτικο φαράγγι. Οι πλαγιές αυτού του φαραγγιού φτάνουν τα 600 μέτρα. Έχει είσοδο από τον χωριό Κοξαρέ και καταλήγει στη λίμνη του Πρέβελη. Ακολουθώντας τα σκαλοπάτια που βρίσκονται πλευρικά του δρόμου Κοξαρέ- Ασώματος φτάνουμε στο βάθος του φαραγγιού, όπου βρίσκεται η εκκλησία του Αγίου Νικολάου. Το φαράγγι διασχίζει ο μεγάλος ποταμός που σε αυτό το σημείο ονομάζεται Κουρταλιώτης. Πρόκειται για ένα φαράγγι εξαιρετικού φυσικού κάλλους, που αξίζει να κάνει κανείς τον κόπο να επισκεφτεί.

Το φαράγγι του Κοτσιφού ξεκινά από το χωριό Κάννεβος και καταλήγει στον Πλακιά. Το σημείο αφετηρίας του είναι αρκετά στενό σε πλάτος περίπου 10 μ., το όποιο σιγά σιγά αυξάνει και φτάνει τα 600μ.. Το συνολικό του μήκος είναι 1.800 μ., και οι σχεδόν κατακόρυφες πλευρές του φτάνουν το ύψος των 600μ.. Μέσα στο φαράγγι υπάρχει ένας μικρός ναός, χτισμένος μέσα σε βραχώδη κοιλότητα.

Το φαράγγι της Πατσού. Το φαράγγι αυτό είναι μια εξαιρετική επιλογή για μικρές εκδρομές και πικ- νικ, καθώς είναι πολύ εύκολο και ξεκούραστο στη διάβαση του. Είναι αξιοποιημένο από τη δασική υπηρεσία. Μάλιστα, στο εσωτερικό του υπάρχει και η σπηλαιώδης εκκλησία του Αγίου Αντωνίου.

Το Αρκαδιώτικο φαράγγι ξεκινά από τη μονή Αρκαδίου και μέσα από μια θαυμάσια διαδρομή καταλήγει στο χωριό Πικρής. Στο χωριό αυτό αντικρίζει κανείς σημαντικά βενετσιάνικα αρχιτεκτονικά στοιχεία.

Το Πρασσανό φαράγγι ξεκινά νότια του χωριού Πρασσές. Αν επιλέξετε να διασχίσετε αυτό το φαράγγι θα περάσετε 3 πολύ ευχάριστες ώρες με τα εντυπωσιακά τοιχώματα των βράχων να σας περιβάλλουν και μερικές δύσβατες προσπελάσεις να φέρνουν την εναλλαγή και να κάνουν το πέρασμά του ιδιαίτερα ενδιαφέρον.